Jõksi koopad asuvad Jõksi külas 14 m kõrguses Kalmetu müüris, mis paikneb Piusa jõest paremal järsus jõekäänus.
Paarsada meetrit müürist põhja pool asub talu. Koopaid on kaks ja neid hüütakse ka Kalmetumäe ehk Kääpamäe koobasteks.

Jõksi Suur koobas on lõunapoolsem ja kujutab laia avaga tagapool vähe kitsenevat ja madalduvat tunnelit pikkusega 12 ja laiusega kuni 4,4 m .
Avara sissekäigu kõrval on vee poolt mõnekümne sentimeetri laiuseks uuristatud püstlõhe- looduslik aken. Selle kõrval ulatub koopa kõrgus 3 m –ni, keskosas 1,7 m-ni.
Koopasse sisse vaadates näeme, et selle põhi on paremal pool umbes 0,7 m kõrgem, moodustades terrassi. Koopa lagi on võlvjas ja põhi jõe poole kallak. Lõpust läheb edasi inimesele läbipääsmatu urg nähtava osa pikkusega üle 5 m. Selle kõrgus on vaid 0,2-0,4 ja laius 0,3-0,5 m. Koopas on näha ka kaks kirde-edela-suunalist püstlõhet.

Jõksi Väike koobas paikneb paarkümmend meetrit esimesest pärivoolu. Kuiva jalaga selle juurde ei pääse, sest vesi ulatub müürini. Tuleb sammuda läbi vee, mis õnneks suvel üle põlve ei ulatu. Selle koopa ava kõrgus on 1,6 ja laius 1,7 m.
Koobas on vaid 3 m pikk ja tagapool kiirest ahenev ning veidi madalduv. Tagaosas võib küürutades püsti seista- kõrgus on siin 1,4 ja laius 1,3 m. Laes esineb püstlõhe asimuudiga 25 kraadi. Jõksi koopad on allikavee uuristuse tagajärg.
Nende omapäraks on püstlõhede esinemine ja huvitavad kavernid seintel, mis moodustunud väljaimmitseva põhjavee toimel. Rahvajutu järgi olevat Jõksi koopaid kasutatud sõdade ajal pelgupaigana.